r语言
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机器学习之逻辑回归(Logit模型)实现—基于R语言(附完整代码)
大家好,我是带我去滑雪! 本期使用R包 ElemStatLearn 的南非心脏病数据 SAheart 进行逻辑回归。其中,响应变量为chd(是否有冠心病,即…
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读取公共数据库中GWAS结果的vcf格式文件
这里以https://gwas.mrcieu.ac.uk/数据库为例 这个数据库中的vcf文件是gwas分析之后的,所以可直接生成GWAS数据文件而不需表型数据。index文件是v…
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二分类结局LASSO回归筛选变量-R操作(从数据开始)+全套代码
一、原始数据处理 如图: 结局status为二分类变量(用0,1表示) 自变量为X1~X15 数据文件名为mydata.csv 二、将数据导入Rstudio 点readr后点击br…
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R语言forestploter包优雅的绘制孟德尔随机化研究森林图
在既往文章中,我们对孟德尔随机化研究做了一个简单的介绍。我们可以发现,使用TwoSampleMR包做出来的森林图并不是很美观。今天我们使用R语言forestploter包优雅的绘制…
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macOS中配置Java开发环境的详细步骤
R语言某些包需要配置Java开发环境,作为一个软件小白,用mac本在安装的时候碰到了很多问题。本帖为自己安装过程的整理,操作写得比较细且很笨蛋,如有问题请各位大神轻喷~ 参考如下:…
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【R包安装】某个编辑包不存在,不存在叫‘xxx‘这个名字的程辑包
一、问题 我在运行是python调用R包出现以下问题: 不存在叫’mclust’这个名字的程辑包 二、解决 1、镜像网站 打开RStudio,在工具栏选择 …
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R | R及Rstudio安装、运行环境变量及RStudio配置
R | R及Rstudio安装、运行环境变量及RStudio配置 一、介绍 1.1 R介绍 1.2 RStudio介绍 二、R安装 2.1 演示电脑系统 2.2 R下载 2.3 R…
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基于rms包的限制性立方样条回归(RCS)R代码实现
1.原理 限制性立方样条(Restricted cubic spline,RCS)是分析非线性关系的最常见的方法之一。RCS用三次函数拟合不同节点之间的曲线并使其平…
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R | R包默认安装路径的查看及修改
R | R包默认安装路径的查看及修改 一、R包安装位置查看 二、已安装R包查询 三、R包安装位置修改 四、R包安装位置永久修改 在【R: R package安装的几种方式】【R: …
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【R语言】——基因GO/KEGG富集分析!超级简单的保姆级教程!
上期“干货预警——原来基因功能富集分析这么简单!”和“【R语言】——基因GO/KEGG功能富集结果可视化(保姆级教程)”介绍如何使用DAVID在线分析工具对基因进行GO/KEGG功…
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R语言基础入门(学习笔记通俗易懂版)
文章目录 R语言预备知识 获取工作目录 设置工作目录 注释 变量名的命名 赋值 变量的显示 查看与清除变量 函数帮助文档查询 函数 安装R包 文件的读取 文件的输出 软件的退出与保…
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R统计绘图-线性混合效应模型详解(理论、模型构建、检验、选择、方差分解及结果可视化)
目录 一、 基础理论 二、数据准备 三、构建线性混合效应模型(LMMs) 3.1 lme4线性混合效应模型formula 3.2 随机截距模型构建及检验 3.3 随机截距模型分析结…
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如何在linux系统中用conda安装R环境及R包
一、miniconda3的安装不再赘述 二、安装R环境 1. 提前准备好conda的R单独环境 conda env list #查看已有环境 conda create -n R4….
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1-R语言科学可视化-数据可视化基础(ggplot安装/数据类型/数据结构/csv数据读取输出/NA处理)
本教程参考书籍《R语言可视化之美》、《R Graphics Cookbook》、《R语言可视化教程》、《ggplot2: Elegant Graphics for Data Ana…
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R语言 gwasglue 包安装
使用github安装包:devtools::install_github(“mrcieu/gwasglue”, force = TRUE) 失败 1.注意先…
